Комитет специальных мероприятий организует, координирует и осуществляет контроль за проведением мероприятий по мобилизационной подготовке в администрации города и в организациях, расположенных на территории муниципального образования город Нефтеюганск, осуществляет защиту государственной тайны, обеспечивает реализацию основных направлений и приоритетов развития и совершенствования в области технической защиты информации.
В своей деятельности комитет специальных мероприятий руководствуется Конституцией Российской Федерации, федеральным законодательством, Уставом города Нефтеюганска, муниципальными правовыми актами, в соответствии с которыми регулируется деятельность органов местного самоуправления города, Федеральным законом Российской Федерации от 26.02.1997 №31-ФЗ «О мобилизационной подготовке и мобилизации в Российской Федерации, Федеральным законом Российской Федерации от 28.03.1998 №53-Ф3 «О воинской обязанности и военной службе», Федеральным законом Российской Федерации от 31.05.1996 №61-ФЗ «Об обороне» и другими нормативными актами по вопросам мобилизационной подготовки Российской Федерации, Законом Российской Федерации от 21.07.1993 №5485-1 «О государственной тайне», Федеральным законом Российской Федерации от 27.07.2006 №152-ФЗ «О персональных данных»,Федеральным законом № 149-ФЗ от 27.07.2006 «Об информации, информационных технологиях и о защите информации» .